O comando "Ctrl+I" inverte a seleção dos sub-objetos (polígonos, arestas, vértice...) ou geometrias.
Se o atalho não estiver funcionando, você pode acessar o "Menu Edit - Select Invert".
Se mesmo assim não funcionar verifique se a opção apontada pela seta na imagem está em amarelo como mostrado.
Esta opção é a "lock selection" e pode ser acionada pela "barra de espaço". Ela visa bloquear os elementos selecionados para que somente eles sejam alterados. Se a opção "lock selection" estiver ativa (em amarelo) o "Ctrl+I" não funcionará. Para desabilitá-lo basta teclar novamente na barra de espaço.